Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 A730009L09Rik-201ENSMUST00000209558 2512 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Pfkfb2-202ENSMUST00000066863 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
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Smg9Q9DB90 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Smg9Q9DB90 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
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Smg9Q9DB90 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
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Smg9Q9DB90 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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Smg9Q9DB90 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Smg9Q9DB90 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Smg9Q9DB90 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Smg9Q9DB90 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Smg9Q9DB90 Slco6d1-202ENSMUST00000160796 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Smg9Q9DB90 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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