Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm11398-201ENSMUST00000120330 320 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm4912-201ENSMUST00000122212 1044 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm13618-201ENSMUST00000128859 384 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 1700061F12Rik-201ENSMUST00000132414 876 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm12762-201ENSMUST00000140881 483 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 4930441J16Rik-201ENSMUST00000153743 516 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm25965-201ENSMUST00000157170 93 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm25667-201ENSMUST00000157701 275 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm42936-201ENSMUST00000174019 652 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Mir5101-201ENSMUST00000175181 83 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Obox4-ps26-201ENSMUST00000176368 724 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm43370-201ENSMUST00000196437 284 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm22897-201ENSMUST00000197860 128 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm35702-201ENSMUST00000198653 511 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm43344-201ENSMUST00000198723 1229 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm43841-201ENSMUST00000199491 586 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm44145-201ENSMUST00000203711 172 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Olfr1309-201ENSMUST00000207885 964 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Olfr879-ps1-201ENSMUST00000212455 694 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm33958-201ENSMUST00000222879 450 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 AC160999.1-201ENSMUST00000225675 810 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 AC133176.1-201ENSMUST00000226668 219 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 CT572983.1-201ENSMUST00000226895 514 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 AC127371.1-201ENSMUST00000228516 312 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 2900092C05Rik-201ENSMUST00000032541 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Vmn1r211-201ENSMUST00000073728 985 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Olfr593-201ENSMUST00000098206 984 ntAPPRIS P2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 A730046J19Rik-201ENSMUST00000135687 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Spag17-204ENSMUST00000164539 7862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 AC167192.3-201ENSMUST00000224096 1567 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Fnbp1l-203ENSMUST00000162947 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm7269-201ENSMUST00000210819 1373 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm17308-201ENSMUST00000181749 1997 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 A530099J19Rik-201ENSMUST00000151029 2764 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Olfr351-201ENSMUST00000100150 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Igkv6-32-201ENSMUST00000103377 366 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Mir465c-2-201ENSMUST00000104757 81 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Igkv13-87-201ENSMUST00000114214 286 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm14901-201ENSMUST00000119001 283 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 4933433F19Rik-201ENSMUST00000180571 1088 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm27036-201ENSMUST00000182465 980 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Mir7028-201ENSMUST00000185016 64 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm42805-201ENSMUST00000196158 276 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 AC154472.2-201ENSMUST00000221186 288 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 AC102603.1-201ENSMUST00000227481 584 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 AC151907.1-201ENSMUST00000228812 412 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Dynlrb2-201ENSMUST00000078170 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm23928-201ENSMUST00000082469 145 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Snord22-201ENSMUST00000083153 126 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Mir465c-1-201ENSMUST00000093560 81 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Olfr1220-201ENSMUST00000099789 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Olfr1220-202ENSMUST00000099806 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Olfr1164-201ENSMUST00000099834 1112 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Cmah-206ENSMUST00000167746 9727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Olfr397-202ENSMUST00000213134 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm45697-201ENSMUST00000212893 2876 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Olfr970-203ENSMUST00000215922 1739 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Btbd35f10-201ENSMUST00000178621 1952 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Fam111a-201ENSMUST00000025595 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm19619-201ENSMUST00000200707 3201 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Pnpla8-201ENSMUST00000043082 13507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 2310003L06Rik-201ENSMUST00000007601 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 AC103672.3-201ENSMUST00000227649 3243 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 AC147639.2-202ENSMUST00000224834 1545 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 5830444F18Rik-201ENSMUST00000194009 1992 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm22199-201ENSMUST00000122660 126 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Zfp931-204ENSMUST00000131702 704 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Mup-ps2-201ENSMUST00000142602 533 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Snord116l12-201ENSMUST00000179816 94 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Vmn1r181-201ENSMUST00000181796 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm6075-201ENSMUST00000186816 486 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm20832-201ENSMUST00000189076 665 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm29479-201ENSMUST00000190352 455 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm29524-201ENSMUST00000190819 699 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm18900-201ENSMUST00000193218 584 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm30638-201ENSMUST00000195570 656 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm36728-201ENSMUST00000195782 665 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm43151-201ENSMUST00000201093 657 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm19131-201ENSMUST00000203408 789 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Gm44946-201ENSMUST00000208425 572 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Apobec3Q99J72 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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