Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm14015-201ENSMUST00000130634 3949 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Olfr1323-203ENSMUST00000213556 5431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC2.59□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Vmn1r81-205ENSMUST00000228764 13763 ntAPPRIS P2 BASIC2.59□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Vmn1r71-202ENSMUST00000226874 5194 ntAPPRIS P2 BASIC2.58□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm7876-202ENSMUST00000171305 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm9218-201ENSMUST00000121068 2694 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 BC055308-201ENSMUST00000193380 2538 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Chl1-201ENSMUST00000066905 7562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm11917-201ENSMUST00000154813 373 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm23927-201ENSMUST00000082466 215 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm7237-201ENSMUST00000148435 1401 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 4930533N22Rik-201ENSMUST00000206433 3509 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm36927-201ENSMUST00000192504 1841 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm8978-201ENSMUST00000124230 2224 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm26145-201ENSMUST00000104476 127 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Mir669d-201ENSMUST00000104644 121 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Vmn1r139-202ENSMUST00000173668 753 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 AC158523.1-201ENSMUST00000221398 328 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Olfr229-201ENSMUST00000076802 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Scel-201ENSMUST00000095576 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Olfr267-202ENSMUST00000216719 4050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Cbll1-204ENSMUST00000185739 3945 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Olfr905-202ENSMUST00000214377 4429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Zfp951-201ENSMUST00000089906 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Olfr853-202ENSMUST00000213834 3888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm24096-201ENSMUST00000103905 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm14607-201ENSMUST00000119119 491 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps151-201ENSMUST00000176956 982 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Mir6413-201ENSMUST00000184049 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm43600-201ENSMUST00000202134 223 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm19366-201ENSMUST00000206996 156 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 4930402F11Rik-201ENSMUST00000207348 1000 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 AC158641.1-201ENSMUST00000218933 229 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 AC153564.2-201ENSMUST00000219464 273 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 AC134537.3-201ENSMUST00000220154 503 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 AC117656.3-204ENSMUST00000225656 859 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Calcrl-202ENSMUST00000099944 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm43845-201ENSMUST00000202462 1820 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm8989-201ENSMUST00000184782 7275 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Dnah12-201ENSMUST00000022433 12009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm10647-201ENSMUST00000098612 2036 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm17916-201ENSMUST00000186137 1342 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 BC002059-202ENSMUST00000190415 1964 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Olfr919-202ENSMUST00000215612 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm12757-201ENSMUST00000119465 800 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm12873-201ENSMUST00000119988 422 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm24537-201ENSMUST00000157950 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm23257-201ENSMUST00000158322 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Mir3569-201ENSMUST00000185080 58 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 1700020G17Rik-202ENSMUST00000190237 739 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 1700019A02Rik-202ENSMUST00000190748 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm9379-201ENSMUST00000196790 646 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm18327-201ENSMUST00000202426 830 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Ly6e-ps1-201ENSMUST00000222501 367 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 AV026068-237ENSMUST00000226075 572 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Mir28a-201ENSMUST00000083560 86 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Nlrp9a-202ENSMUST00000108387 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Olfr1180-202ENSMUST00000216121 2079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Olfr1009-203ENSMUST00000216443 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm28362-201ENSMUST00000189430 2420 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Wwp1-201ENSMUST00000035982 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm22472-201ENSMUST00000104115 134 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm12213-201ENSMUST00000119924 353 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm14810-201ENSMUST00000121628 486 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 n-R5s45-201ENSMUST00000122592 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 4930597A21Rik-201ENSMUST00000128652 698 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm2892-201ENSMUST00000145537 711 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm22722-201ENSMUST00000157467 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm22833-201ENSMUST00000158292 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Rpl48-ps1-201ENSMUST00000177147 556 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Scgb2b21-201ENSMUST00000185407 520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm6075-201ENSMUST00000186816 486 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm28069-201ENSMUST00000189926 214 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Etd-201ENSMUST00000074232 478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm25755-201ENSMUST00000083396 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Olfr1104-201ENSMUST00000099869 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Cfh-206ENSMUST00000192880 3746 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Ogt-201ENSMUST00000044475 5384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm4211-201ENSMUST00000181103 2220 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Macf1-203ENSMUST00000097897 23495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm18913-201ENSMUST00000204311 1789 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm38240-201ENSMUST00000195110 2487 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm43319-201ENSMUST00000198036 2270 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Olfr1173-201ENSMUST00000099830 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm42841-201ENSMUST00000199806 1932 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Olfr393-201ENSMUST00000102523 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm25938-201ENSMUST00000104139 166 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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