Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Gm8820-201ENSMUST00000204077 571 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm20997-201ENSMUST00000205148 231 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 AC134528.1-201ENSMUST00000219156 387 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm32443-202ENSMUST00000220011 773 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Olfr906-201ENSMUST00000045493 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Ifnk-201ENSMUST00000058595 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Olfr690-201ENSMUST00000061920 1062 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Olfr748-201ENSMUST00000073561 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm25699-201ENSMUST00000082896 167 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Mir34b-201ENSMUST00000083558 84 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm22829-201ENSMUST00000083771 106 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Olfr1241-201ENSMUST00000099778 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Olfr1217-203ENSMUST00000214022 3947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Clca4c-ps-202ENSMUST00000200595 2779 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Cacnb4-202ENSMUST00000102760 7872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm45872-201ENSMUST00000209804 1584 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Vmn1r72-202ENSMUST00000209638 6501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Hsfy2-201ENSMUST00000062085 1392 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Acsm3-202ENSMUST00000106526 2704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Olfr362-202ENSMUST00000213817 4059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm37696-201ENSMUST00000194223 3349 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Cmah-206ENSMUST00000167746 9727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Spag17-204ENSMUST00000164539 7862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Olfr194-203ENSMUST00000216519 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Mir208b-201ENSMUST00000104735 77 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm14282-201ENSMUST00000119484 240 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm12607-201ENSMUST00000120724 493 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm11579-201ENSMUST00000145502 845 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm14902-201ENSMUST00000145576 1007 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm24745-201ENSMUST00000157840 85 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm23032-201ENSMUST00000157995 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm24850-201ENSMUST00000158029 119 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 V1rd19-201ENSMUST00000173571 1157 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm42936-201ENSMUST00000174019 652 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm28560-201ENSMUST00000186091 315 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm18448-201ENSMUST00000186286 599 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm28334-201ENSMUST00000186653 315 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm3496-201ENSMUST00000188283 745 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm28495-201ENSMUST00000188452 315 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm28232-201ENSMUST00000188683 315 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm29598-201ENSMUST00000188996 588 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm28481-201ENSMUST00000189231 315 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 1700023F02Rik-203ENSMUST00000189619 473 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm29059-201ENSMUST00000191534 315 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm37765-201ENSMUST00000192395 315 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm37237-201ENSMUST00000192893 315 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm36968-201ENSMUST00000193737 315 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm38290-201ENSMUST00000195238 315 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm36017-201ENSMUST00000199005 923 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Fth-ps3-201ENSMUST00000210405 358 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Eif1-ps1-201ENSMUST00000086606 330 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Olfr893-201ENSMUST00000093867 942 ntAPPRIS P2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 AC156025.1-201ENSMUST00000223597 3551 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm29325-201ENSMUST00000190705 2528 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm42680-201ENSMUST00000196238 2500 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Vmn1r209-202ENSMUST00000227038 6461 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Kif20b-201ENSMUST00000087341 5564 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Vmn1r49-202ENSMUST00000203791 1356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Stag2-202ENSMUST00000115072 5955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 4932438A13Rik-217ENSMUST00000152564 15541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Olfr801-204ENSMUST00000216067 4014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm2912-201ENSMUST00000223472 1799 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm15518-201ENSMUST00000127115 2108 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Ank2-208ENSMUST00000182078 14305 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Olfr181-204ENSMUST00000205986 1891 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Olfr578-202ENSMUST00000215606 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Olfr617-203ENSMUST00000216516 3083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm13321-201ENSMUST00000117101 400 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm14899-201ENSMUST00000118673 548 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm12486-201ENSMUST00000120887 541 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm14228-201ENSMUST00000131908 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm13274-202ENSMUST00000137624 271 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm26271-201ENSMUST00000158349 104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Zfp456-202ENSMUST00000172266 679 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm23816-201ENSMUST00000179617 132 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm29552-201ENSMUST00000190548 660 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm34068-201ENSMUST00000193310 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Mir129b-201ENSMUST00000197461 65 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Fbxw23-201ENSMUST00000198015 425 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm43276-201ENSMUST00000199712 364 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm42500-201ENSMUST00000199898 517 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Gm32772-201ENSMUST00000205898 594 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 4930448F12Rik-201ENSMUST00000220795 859 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 AC133189.2-201ENSMUST00000228527 392 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Tshb-201ENSMUST00000029450 605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Creg1-201ENSMUST00000040298 425 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Olfr1490-201ENSMUST00000080162 951 ntAPPRIS P2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Olfr715b-201ENSMUST00000081044 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 n-R5s54-201ENSMUST00000083837 112 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Olfr1221-201ENSMUST00000099795 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Olfr1049-201ENSMUST00000099899 953 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Olfr586-202ENSMUST00000211075 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Krt40Q6IFX3 Akap6-201ENSMUST00000095737 14847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms