Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1245-202ENSMUST00000217402 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Sft2d1Q5SSN7 AC159188.2-201ENSMUST00000224103 1301 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Sft2d1Q5SSN7 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Sft2d1Q5SSN7 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r34-205ENSMUST00000227332 3075 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1309-202ENSMUST00000214537 4274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1286-202ENSMUST00000184954 3398 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm2042-201ENSMUST00000110145 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Sft2d1Q5SSN7 Olfr351-201ENSMUST00000100150 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Sft2d1Q5SSN7 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm12149-201ENSMUST00000117511 654 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm13210-201ENSMUST00000121483 273 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm15065-201ENSMUST00000121699 273 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm15521-201ENSMUST00000141752 835 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm22532-201ENSMUST00000158822 140 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm1992-201ENSMUST00000161581 250 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Sft2d1Q5SSN7 Spin2f-201ENSMUST00000177990 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Sft2d1Q5SSN7 D830030K20Rik-202ENSMUST00000178670 441 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm21834-201ENSMUST00000178907 453 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Sft2d1Q5SSN7 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Sft2d1Q5SSN7 Ikzf2-209ENSMUST00000191262 1146 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm20162-201ENSMUST00000193629 871 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm43104-201ENSMUST00000197234 311 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1311-201ENSMUST00000208536 943 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1266-ps1-201ENSMUST00000214850 180 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm21007-201ENSMUST00000221024 326 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Sft2d1Q5SSN7 AC154198.1-201ENSMUST00000222839 424 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Sft2d1Q5SSN7 AC117588.3-201ENSMUST00000228517 325 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Sft2d1Q5SSN7 Acrv1-201ENSMUST00000034620 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Sft2d1Q5SSN7 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Sft2d1Q5SSN7 Olfr779-201ENSMUST00000069063 390 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Sft2d1Q5SSN7 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Olfr25-203ENSMUST00000214155 6479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r13-204ENSMUST00000227421 5235 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 4933436I01Rik-201ENSMUST00000026325 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl1-203ENSMUST00000121477 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm20557-201ENSMUST00000192871 2794 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm14811-201ENSMUST00000117070 117 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm13567-201ENSMUST00000118026 247 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm12328-201ENSMUST00000118611 197 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm12994-201ENSMUST00000119601 447 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm12213-201ENSMUST00000119924 353 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm25105-201ENSMUST00000122477 130 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s68-201ENSMUST00000122639 82 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm16290-201ENSMUST00000161175 474 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm6155-201ENSMUST00000173735 341 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 1700031A10Rik-201ENSMUST00000174380 656 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Obox4-ps6-201ENSMUST00000176578 724 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm21170-201ENSMUST00000179330 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Mir6410-201ENSMUST00000184204 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm19637-201ENSMUST00000185933 579 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm28786-201ENSMUST00000187228 172 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm28534-201ENSMUST00000187744 676 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm37431-201ENSMUST00000195102 111 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm6510-201ENSMUST00000195916 574 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm43468-201ENSMUST00000199769 397 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm43039-201ENSMUST00000202883 963 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Nasp-ps1-201ENSMUST00000205050 691 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm45553-201ENSMUST00000209929 507 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm6929-201ENSMUST00000210930 468 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 AL669916.5-201ENSMUST00000214874 361 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 AC163621.2-201ENSMUST00000222229 682 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 AC127371.1-202ENSMUST00000228923 306 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm5548-201ENSMUST00000055878 397 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 4930512M02Rik-201ENSMUST00000081896 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Olfr262-201ENSMUST00000087818 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Defb33-201ENSMUST00000098908 424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1167-201ENSMUST00000099832 1100 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Evi2b-201ENSMUST00000179322 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm40020-201ENSMUST00000215677 1635 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1043-203ENSMUST00000213949 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Traj24-201ENSMUST00000103717 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm23271-201ENSMUST00000104052 124 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm16089-201ENSMUST00000117679 336 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps126-201ENSMUST00000117681 926 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm13064-201ENSMUST00000119125 557 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm15142-201ENSMUST00000121013 856 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm11385-201ENSMUST00000121513 570 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm5963-201ENSMUST00000143451 236 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm25386-201ENSMUST00000157814 288 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Sft2d1Q5SSN7 Gm24213-201ENSMUST00000158255 258 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms