Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28047Q3US59 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28047Q3US59 Gm26680-203ENSMUST00000181701 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28047Q3US59 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28047Q3US59 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28047Q3US59 Gm35755-201ENSMUST00000222392 2077 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28047Q3US59 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28047Q3US59 Gm14305-202ENSMUST00000108981 1646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28047Q3US59 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28047Q3US59 Olfr123-203ENSMUST00000216051 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28047Q3US59 Gm13510-201ENSMUST00000118659 429 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28047Q3US59 Gm15553-201ENSMUST00000118757 430 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28047Q3US59 Gmfg-ps-201ENSMUST00000121071 427 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28047Q3US59 Gm14559-201ENSMUST00000121745 496 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28047Q3US59 4930405D11Rik-201ENSMUST00000132218 568 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Gm28047Q3US59 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28047Q3US59 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Gm28047Q3US59 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28047Q3US59 Gm37881-201ENSMUST00000193001 421 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28047Q3US59 Gm37817-201ENSMUST00000195276 434 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28047Q3US59 BX530055.1-201ENSMUST00000197285 122 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28047Q3US59 Gm43494-201ENSMUST00000197672 388 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28047Q3US59 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28047Q3US59 4930428D20Rik-201ENSMUST00000201886 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Gm28047Q3US59 Gm33962-202ENSMUST00000205195 630 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Gm28047Q3US59 Gm34005-201ENSMUST00000215834 282 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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Gm28047Q3US59 Kcnh8-201ENSMUST00000039366 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Gm28047Q3US59 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm28047Q3US59 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm28047Q3US59 Btf3l4-204ENSMUST00000102742 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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Gm28047Q3US59 Lcorl-204ENSMUST00000087164 4979 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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Gm28047Q3US59 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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Gm28047Q3US59 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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Gm28047Q3US59 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm28047Q3US59 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm28047Q3US59 Vmn2r94-201ENSMUST00000172190 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm28047Q3US59 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm28047Q3US59 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm28047Q3US59 Vmn1r189-202ENSMUST00000227357 3245 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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Gm28047Q3US59 Vmn1r90-202ENSMUST00000226264 7796 ntAPPRIS P2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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Gm28047Q3US59 Cnot1-202ENSMUST00000098473 8390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm28047Q3US59 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm28047Q3US59 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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Gm28047Q3US59 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm28047Q3US59 Gm44847-201ENSMUST00000207104 1991 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm28047Q3US59 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm28047Q3US59 Abca13-201ENSMUST00000042740 16011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm28047Q3US59 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm28047Q3US59 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Gm28047Q3US59 Mir879-201ENSMUST00000104703 76 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms