Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Mug-ps1-203ENSMUST00000190643 655 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm28267-201ENSMUST00000191093 265 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm43104-201ENSMUST00000197234 311 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Mbd3l1-203ENSMUST00000215255 708 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 AC192616.3-201ENSMUST00000220797 1124 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm9628-201ENSMUST00000222169 725 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm3565-201ENSMUST00000222670 609 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Sprr2g-201ENSMUST00000056590 650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Olfr1408-201ENSMUST00000073663 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Olfr877-201ENSMUST00000086063 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Zfp595-203ENSMUST00000168892 4040 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Olfr235-206ENSMUST00000215407 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gprc6a-203ENSMUST00000219286 2574 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm37900-201ENSMUST00000195510 3805 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm15518-201ENSMUST00000127115 2108 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Zfp850-203ENSMUST00000180502 6163 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm37363-201ENSMUST00000192336 2233 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Olfr729-202ENSMUST00000213163 4283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Ptprz1-201ENSMUST00000090568 8068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Lpar4-201ENSMUST00000060576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 2210407C18Rik-202ENSMUST00000108821 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm11874-201ENSMUST00000117437 130 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm11673-201ENSMUST00000117846 331 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm14649-201ENSMUST00000121814 324 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm12103-201ENSMUST00000121892 362 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm6182-201ENSMUST00000156439 1208 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm22794-201ENSMUST00000157228 306 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Klrc1-204ENSMUST00000169545 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm23215-201ENSMUST00000178153 121 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Mir6996-201ENSMUST00000183922 61 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm28596-201ENSMUST00000185870 696 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm28643-201ENSMUST00000188811 356 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm28811-201ENSMUST00000190650 442 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm37808-201ENSMUST00000192038 442 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm32295-201ENSMUST00000192558 696 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm31260-201ENSMUST00000193478 696 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm38045-201ENSMUST00000193536 199 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm43856-201ENSMUST00000197004 369 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm7468-201ENSMUST00000203900 652 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm44278-201ENSMUST00000204082 312 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 2610306O10Rik-201ENSMUST00000206512 612 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm44871-201ENSMUST00000207821 497 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm18268-201ENSMUST00000208445 943 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm3690-201ENSMUST00000211341 262 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 AC153938.2-201ENSMUST00000218388 580 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 AC158523.1-201ENSMUST00000221398 328 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 AC140344.1-201ENSMUST00000223384 387 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 AC154506.3-201ENSMUST00000225417 213 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 AC122937.1-201ENSMUST00000226405 793 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Ifnk-201ENSMUST00000058595 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Tas2r106-201ENSMUST00000076756 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm24928-201ENSMUST00000083399 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm25897-201ENSMUST00000083709 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Olfr661-202ENSMUST00000214876 3790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 9330158H04Rik-201ENSMUST00000101535 3174 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 AC123705.2-201ENSMUST00000221653 2009 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 AC101945.4-201ENSMUST00000228464 1976 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm14014-201ENSMUST00000156718 2717 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Olfr1196-203ENSMUST00000216977 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Olfr716-207ENSMUST00000216871 4062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm37652-201ENSMUST00000195290 2095 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Oog1-201ENSMUST00000095509 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Cfhr1-201ENSMUST00000023965 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Cfh-203ENSMUST00000111977 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Mir669p-2-201ENSMUST00000103868 87 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Mir669p-1-201ENSMUST00000103884 87 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm26075-201ENSMUST00000104062 121 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm22472-201ENSMUST00000104115 134 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm24281-201ENSMUST00000104234 136 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Tmc4-ps-201ENSMUST00000117819 258 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm15854-201ENSMUST00000118879 808 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm14591-201ENSMUST00000120407 518 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm12748-201ENSMUST00000120763 504 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm11931-201ENSMUST00000121630 447 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm12087-201ENSMUST00000121878 258 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps3-201ENSMUST00000122439 917 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Platr16-202ENSMUST00000150529 545 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm24690-201ENSMUST00000157759 97 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps62-201ENSMUST00000174119 616 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm21883-201ENSMUST00000179028 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm26683-201ENSMUST00000181737 470 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm27235-201ENSMUST00000184431 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm29191-201ENSMUST00000185427 621 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm18667-201ENSMUST00000186523 484 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Scgb2b6-201ENSMUST00000188132 330 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm28486-201ENSMUST00000188443 621 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm28550-201ENSMUST00000189125 618 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm28460-202ENSMUST00000190590 618 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm29130-201ENSMUST00000191015 618 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm43892-201ENSMUST00000204373 265 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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