Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Vmn2r-ps43-201ENSMUST00000173798 2473 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm3665-201ENSMUST00000177214 2461 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Vmn2r-ps51-201ENSMUST00000177271 2461 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Olfr196-202ENSMUST00000205471 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm38407-202ENSMUST00000219221 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Arhgap18-201ENSMUST00000039557 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm44435-201ENSMUST00000204379 4119 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm26853-201ENSMUST00000180757 4010 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 AC155805.1-201ENSMUST00000222419 3808 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Sult1b1-201ENSMUST00000031199 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm45160-201ENSMUST00000207112 3099 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Kcnb2-201ENSMUST00000170146 14845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm43508-201ENSMUST00000197251 3783 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Olfr1251-201ENSMUST00000214304 3133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Vmn1r42-202ENSMUST00000226436 4045 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm7133-201ENSMUST00000187797 2039 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 AC167192.3-201ENSMUST00000224096 1567 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 AC154677.1-201ENSMUST00000227636 2805 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Zfp426-213ENSMUST00000169558 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Olfr665-203ENSMUST00000216257 2298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Olfr1020-202ENSMUST00000215347 2640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Olfr107-205ENSMUST00000216844 4021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 4921515E04Rik-202ENSMUST00000226383 1738 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm14322-201ENSMUST00000108942 1074 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm14067-201ENSMUST00000119340 314 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm12231-201ENSMUST00000119447 695 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm13170-201ENSMUST00000119716 643 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm14322-202ENSMUST00000119838 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Olfr1027-ps1-201ENSMUST00000122338 875 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm14418-202ENSMUST00000128657 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm4675-201ENSMUST00000163396 502 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm21518-201ENSMUST00000178115 567 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm20736-201ENSMUST00000178198 567 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm20843-201ENSMUST00000178505 567 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm21209-201ENSMUST00000178556 567 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm21258-201ENSMUST00000178673 567 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm21650-201ENSMUST00000179073 567 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm21850-201ENSMUST00000179792 359 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm25942-201ENSMUST00000180080 110 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm20937-201ENSMUST00000180329 567 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm34015-201ENSMUST00000194908 451 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm38109-201ENSMUST00000195386 181 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm43841-201ENSMUST00000199491 586 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
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Hoxd1Q01822 Gm17991-201ENSMUST00000208139 297 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm45702-201ENSMUST00000211856 644 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 AC164567.4-201ENSMUST00000219708 483 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 AC162376.1-201ENSMUST00000220120 435 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 AC159622.3-201ENSMUST00000221010 361 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 AC122465.3-201ENSMUST00000221644 355 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
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Hoxd1Q01822 Mir134-201ENSMUST00000083492 71 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm44283-201ENSMUST00000204461 3950 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 5930409G06Rik-201ENSMUST00000192347 1544 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Ptgs2-201ENSMUST00000035065 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Olfr59-201ENSMUST00000143976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 2610002M06Rik-201ENSMUST00000120722 5842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Olfr556-202ENSMUST00000213485 3825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Fgf7-202ENSMUST00000110442 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Vmn1r215-202ENSMUST00000228092 2790 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Atp1b4-201ENSMUST00000016471 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm37764-201ENSMUST00000194664 2150 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Olfr933-202ENSMUST00000216238 4475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Olfr145-202ENSMUST00000213688 6691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm5127-202ENSMUST00000101297 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm13088-201ENSMUST00000105771 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Vmn1r10-202ENSMUST00000228270 2084 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Olfr699-202ENSMUST00000215952 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Cep290-206ENSMUST00000219765 7985 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Olfr726-203ENSMUST00000213345 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Igf1-202ENSMUST00000095360 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Neto2-201ENSMUST00000109686 5610 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Vmn1r210-202ENSMUST00000226180 3116 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 1700049E17Rik1-201ENSMUST00000095985 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm23424-201ENSMUST00000103889 110 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Pbsn-202ENSMUST00000114041 697 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm12062-201ENSMUST00000117533 259 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 1700034E13Rik-202ENSMUST00000118724 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Rps18-ps2-201ENSMUST00000119493 398 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm14586-201ENSMUST00000119571 408 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Hspe1-ps6-201ENSMUST00000120275 283 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm16100-201ENSMUST00000120489 231 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm13932-201ENSMUST00000120873 610 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm13661-201ENSMUST00000154297 318 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm23591-201ENSMUST00000157663 286 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm25667-201ENSMUST00000157701 275 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm23496-201ENSMUST00000157741 248 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm24689-201ENSMUST00000157760 104 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Mir1946a-201ENSMUST00000158360 134 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms