Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Trbv8-201ENSMUST00000194020 285 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm37791-201ENSMUST00000195081 286 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm18747-201ENSMUST00000198129 648 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm40155-201ENSMUST00000198291 818 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm15927-204ENSMUST00000206075 372 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm4501-201ENSMUST00000207330 551 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm4528-201ENSMUST00000207905 551 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm44715-201ENSMUST00000209049 3839 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm6929-201ENSMUST00000210930 468 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 AC152946.2-201ENSMUST00000219071 337 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 AC158631.2-201ENSMUST00000219999 478 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 AC149586.1-201ENSMUST00000222647 645 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm40598-201ENSMUST00000222953 547 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 AC154368.1-201ENSMUST00000223465 205 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Tmed11-201ENSMUST00000004943 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Vmn1r68-201ENSMUST00000058362 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Olfr178-201ENSMUST00000058564 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm10042-201ENSMUST00000079884 78 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Olfr715b-201ENSMUST00000081044 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm24144-201ENSMUST00000082632 111 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm23815-201ENSMUST00000083231 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm26165-201ENSMUST00000083791 138 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm25005-201ENSMUST00000083812 156 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm22864-201ENSMUST00000083950 130 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm23520-201ENSMUST00000093736 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Olfr1137-201ENSMUST00000099850 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Olfr154-201ENSMUST00000099918 1079 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm26733-201ENSMUST00000180846 2046 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm37158-201ENSMUST00000191652 5704 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Olfr1211-203ENSMUST00000213412 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm37064-201ENSMUST00000193851 2231 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 AC116557.1-201ENSMUST00000219494 1521 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Zfp990-202ENSMUST00000105742 2996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm5570-202ENSMUST00000101355 2527 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm34549-201ENSMUST00000207057 1611 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm20619-201ENSMUST00000175814 2008 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Olfr918-202ENSMUST00000215461 3783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Tcrg-C1-201ENSMUST00000103558 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm12125-201ENSMUST00000117261 736 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm5757-201ENSMUST00000117494 528 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Psmb7-ps2-201ENSMUST00000118546 820 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm12739-201ENSMUST00000119769 382 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm14810-201ENSMUST00000121628 486 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm13471-201ENSMUST00000122057 433 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm5963-201ENSMUST00000143451 236 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm23112-201ENSMUST00000158606 125 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm12002-203ENSMUST00000174550 923 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm24811-201ENSMUST00000175313 100 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm25999-201ENSMUST00000175398 133 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Vmn1r-ps14-201ENSMUST00000176859 913 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm28141-201ENSMUST00000186676 342 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Snhg14-207ENSMUST00000188162 770 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 1700066N21Rik-201ENSMUST00000190123 783 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm4035-202ENSMUST00000190684 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm29130-201ENSMUST00000191015 618 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm37828-201ENSMUST00000192496 432 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm38108-201ENSMUST00000193891 399 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm37418-201ENSMUST00000195031 274 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm567-201ENSMUST00000197127 469 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm43604-201ENSMUST00000199799 705 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm6064-201ENSMUST00000203999 454 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm44294-201ENSMUST00000205090 728 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm38997-201ENSMUST00000205669 304 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm44877-201ENSMUST00000206485 274 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Olfr840-ps1-201ENSMUST00000211827 917 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Olfr1266-ps1-201ENSMUST00000214850 180 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Mbd3l1-203ENSMUST00000215255 708 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm34158-201ENSMUST00000216390 567 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 AC121286.1-201ENSMUST00000218811 380 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Cldn34c4-201ENSMUST00000052500 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm9958-201ENSMUST00000068250 1284 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Olfr818-201ENSMUST00000074308 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Olfr1465-201ENSMUST00000080142 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm25481-201ENSMUST00000083221 158 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Hspd1-ps1-201ENSMUST00000203513 1670 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Olfr732-202ENSMUST00000213701 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Ccr2-202ENSMUST00000165984 3515 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm6325-201ENSMUST00000122015 3114 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 C87414-206ENSMUST00000162964 2852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 AC159193.2-201ENSMUST00000220865 4251 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm3259-201ENSMUST00000101015 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Olfr1293-ps-203ENSMUST00000217845 3628 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 A830019L24Rik-201ENSMUST00000197226 1652 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Olfr397-204ENSMUST00000216291 4168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Nlrp9a-202ENSMUST00000108387 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm23273-201ENSMUST00000104058 135 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm25765-201ENSMUST00000104100 132 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm24671-201ENSMUST00000104159 158 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm24890-201ENSMUST00000104389 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Cd59b-204ENSMUST00000111132 436 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Rpl35-ps1-201ENSMUST00000118070 372 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm15854-201ENSMUST00000118879 808 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms