Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm9443-201ENSMUST00000188406 816 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm43355-201ENSMUST00000196541 346 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm43449-201ENSMUST00000202955 371 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm9560-201ENSMUST00000205012 1201 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm31294-201ENSMUST00000211216 138 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Olfr27-202ENSMUST00000216405 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Olfr1369-ps1-201ENSMUST00000079050 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Olfr722-201ENSMUST00000053290 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Lrrc4c-201ENSMUST00000059049 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm42869-201ENSMUST00000199953 2121 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Olfr205-202ENSMUST00000213910 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Vmn1r171-211ENSMUST00000228559 2637 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm43175-201ENSMUST00000198450 3810 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Vmn1r169-205ENSMUST00000228832 2749 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Olfr1408-202ENSMUST00000200689 3453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 6820402A03Rik-201ENSMUST00000194648 2654 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm13510-201ENSMUST00000118659 429 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm11737-201ENSMUST00000118713 468 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Klrc2-204ENSMUST00000119533 717 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm13537-201ENSMUST00000120467 267 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm26372-201ENSMUST00000157831 236 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm17206-201ENSMUST00000168123 577 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Rpl9-ps5-201ENSMUST00000174221 571 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Vmn2r-ps6-201ENSMUST00000176317 1101 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Obox3-ps5-201ENSMUST00000176412 1003 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm23047-201ENSMUST00000177661 94 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Ly6c1-203ENSMUST00000185200 540 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Mrgprc1-ps-201ENSMUST00000185552 952 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Rhoay-ps2-201ENSMUST00000186362 581 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm2325-201ENSMUST00000186637 581 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm6137-201ENSMUST00000187552 578 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm20923-201ENSMUST00000190009 319 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm36971-201ENSMUST00000195244 378 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm43144-201ENSMUST00000198256 485 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm44720-201ENSMUST00000206076 260 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm18854-201ENSMUST00000211196 329 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm17989-201ENSMUST00000211543 412 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Olfr348-201ENSMUST00000056865 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm25410-201ENSMUST00000083758 137 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Obox4-ps12-201ENSMUST00000180084 1362 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Olfr855-202ENSMUST00000215587 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm33609-201ENSMUST00000198559 2694 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Nlgn1-202ENSMUST00000108308 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 AC126439.1-201ENSMUST00000226772 2104 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Akr1c14-201ENSMUST00000041768 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Ermn-201ENSMUST00000090940 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Olfr808-202ENSMUST00000203236 4523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm38091-201ENSMUST00000192418 3871 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm8104-201ENSMUST00000168165 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm9611-201ENSMUST00000100698 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm15112-201ENSMUST00000120152 860 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Olfr404-ps1-201ENSMUST00000121065 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm3531-201ENSMUST00000162698 489 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Gm3633-202ENSMUST00000163102 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PdgfaP20033 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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