Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm15226-201ENSMUST00000156526 2971 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Vmn2r108-201ENSMUST00000167314 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm18180-201ENSMUST00000187562 1484 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Nlrp4b-202ENSMUST00000117413 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 AC124572.2-201ENSMUST00000218041 5152 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm38057-201ENSMUST00000195551 3203 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Olfr1454-203ENSMUST00000214695 4049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm24951-201ENSMUST00000102182 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm26377-201ENSMUST00000102184 108 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Trappc1-203ENSMUST00000102602 751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm14393-202ENSMUST00000109066 564 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm12982-201ENSMUST00000117408 190 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm16089-201ENSMUST00000117679 336 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm12509-201ENSMUST00000118033 609 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Psmb7-ps2-201ENSMUST00000118546 820 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Snrpert-201ENSMUST00000121967 279 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm15350-201ENSMUST00000135138 569 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 4930555B12Rik-201ENSMUST00000135444 283 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm43191-201ENSMUST00000140672 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm25883-201ENSMUST00000157781 271 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Mir1946b-201ENSMUST00000157853 133 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 1700058P15Rik-201ENSMUST00000159981 413 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm20542-201ENSMUST00000174582 372 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Mir3112-201ENSMUST00000175431 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm20777-201ENSMUST00000177818 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm5558-201ENSMUST00000178933 495 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm20873-201ENSMUST00000179410 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm20737-201ENSMUST00000179665 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm22307-201ENSMUST00000180019 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm21310-201ENSMUST00000180130 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm21425-201ENSMUST00000180318 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm20574-201ENSMUST00000182867 917 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm27733-201ENSMUST00000184803 68 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm28847-201ENSMUST00000186778 700 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm18505-201ENSMUST00000187360 790 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm17916-202ENSMUST00000187634 1187 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm29365-201ENSMUST00000189461 699 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm44402-201ENSMUST00000203677 238 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm43954-201ENSMUST00000204634 544 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm45912-201ENSMUST00000210646 543 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 AC120540.1-201ENSMUST00000221879 324 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 CT030184.1-201ENSMUST00000222393 416 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 AC158525.1-201ENSMUST00000223806 576 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 AC168880.1-201ENSMUST00000225113 707 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 AC144819.1-201ENSMUST00000227015 620 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Scrg1-201ENSMUST00000034023 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Olfr924-201ENSMUST00000072977 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm22304-201ENSMUST00000082688 129 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Snora70-201ENSMUST00000083047 137 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 n-R5s196-201ENSMUST00000083136 117 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm25581-201ENSMUST00000083410 164 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm10212-201ENSMUST00000087884 324 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm6043-201ENSMUST00000099961 492 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 AC153150.1-201ENSMUST00000226065 3782 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm20619-201ENSMUST00000175814 2008 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Ghr-208ENSMUST00000161561 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm42486-201ENSMUST00000200369 3486 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm11284-201ENSMUST00000121910 1887 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm12374-201ENSMUST00000147108 3299 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Vmn1r74-202ENSMUST00000228471 6608 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Skint4-202ENSMUST00000106564 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Skint4-204ENSMUST00000106566 3997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Vmn1r66-201ENSMUST00000060374 1524 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Postn-203ENSMUST00000107985 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Vmn2r-ps46-201ENSMUST00000172969 2556 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm28154-201ENSMUST00000186267 4218 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm2042-207ENSMUST00000181326 2440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm8675-201ENSMUST00000201408 1856 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Dram2-201ENSMUST00000029507 1891 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Olfr819-202ENSMUST00000216322 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Mga-202ENSMUST00000079934 13304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Ndst4-204ENSMUST00000173932 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm6913-201ENSMUST00000100019 348 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm25096-201ENSMUST00000104043 129 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm22472-201ENSMUST00000104115 134 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Mir105-201ENSMUST00000104655 80 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm14932-201ENSMUST00000117112 453 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Tcea1-ps1-201ENSMUST00000117942 904 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm7429-201ENSMUST00000118664 348 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm13815-201ENSMUST00000119963 412 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Dnajc19-ps-201ENSMUST00000120890 351 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm14463-201ENSMUST00000121117 498 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Vpreb1P13372 Gm16157-201ENSMUST00000124813 534 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms