Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 AC125311.1-201ENSMUST00000226950 220 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
P10404 AC138765.1-201ENSMUST00000228657 385 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
P10404 Lcn4-201ENSMUST00000028283 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
P10404 Olfr1341-201ENSMUST00000061215 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
P10404 Bcl2l15-201ENSMUST00000062945 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
P10404 Olfr345-201ENSMUST00000076850 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
P10404 Gm25792-201ENSMUST00000083289 100 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
P10404 Gm10222-201ENSMUST00000088336 294 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
P10404 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
P10404 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
P10404 Vmn2r117-201ENSMUST00000171996 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
P10404 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
P10404 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
P10404 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
P10404 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
P10404 Gm29506-201ENSMUST00000191045 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
P10404 Mrgprb1-201ENSMUST00000094384 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
P10404 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
P10404 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
P10404 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
P10404 Olfr947-ps1-201ENSMUST00000214075 2165 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.66
P10404 Cd226-201ENSMUST00000037142 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
P10404 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
P10404 Vmn2r-ps120-201ENSMUST00000176341 2409 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
P10404 Mmp1a-202ENSMUST00000217651 2011 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
P10404 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
P10404 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
P10404 AC116726.1-201ENSMUST00000215028 3497 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
P10404 Gm12255-201ENSMUST00000117184 284 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Vmn1r-ps125-201ENSMUST00000117767 290 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Gm12110-201ENSMUST00000121601 579 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Gm12815-201ENSMUST00000121737 135 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Xlr5e-ps-201ENSMUST00000122043 711 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Gm17430-201ENSMUST00000171339 474 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Gm25156-201ENSMUST00000179809 79 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Gm23523-201ENSMUST00000180190 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Gm11395-201ENSMUST00000181011 499 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Gm11394-201ENSMUST00000181421 517 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Gm29540-201ENSMUST00000188207 337 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Vmn2r-ps149-201ENSMUST00000188423 590 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Faiml-202ENSMUST00000188555 560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 2010110G14Rik-201ENSMUST00000196438 527 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Gm43154-210ENSMUST00000210190 1051 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 CAAA01216754.6-201ENSMUST00000217183 398 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Gm46327-201ENSMUST00000218240 365 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Olfr6-204ENSMUST00000219365 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Erich6b-201ENSMUST00000022579 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Gm5689-201ENSMUST00000041389 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Defb11-201ENSMUST00000051965 317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 4930578G10Rik-201ENSMUST00000068158 614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Vmn1r13-201ENSMUST00000078885 903 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Slco1a5-203ENSMUST00000111825 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Lcorl-204ENSMUST00000087164 4979 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Vmn1r184-204ENSMUST00000227534 4807 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Ino80d-205ENSMUST00000165066 13529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Piga-201ENSMUST00000033754 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Olfr722-201ENSMUST00000053290 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Pramel4-201ENSMUST00000084191 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Zfp119b-202ENSMUST00000189452 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
P10404 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Vmn2r112-201ENSMUST00000097381 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Olfr457-203ENSMUST00000204324 4275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Gm45483-201ENSMUST00000209845 1682 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 AC147615.2-201ENSMUST00000219876 2154 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Gm6645-201ENSMUST00000118505 2726 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Olfr1268-ps1-201ENSMUST00000117787 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Olfr629-203ENSMUST00000216300 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Gm15994-201ENSMUST00000118029 402 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Gm15981-201ENSMUST00000119196 457 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105 ms