Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm11456-201ENSMUST00000121070 256 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 2210414B05Rik-201ENSMUST00000139600 872 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm5798-202ENSMUST00000179987 582 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Tmed11-201ENSMUST00000004943 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm25141-201ENSMUST00000083177 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr644-203ENSMUST00000213991 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Vmn1r80-209ENSMUST00000228578 11005 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr826-203ENSMUST00000216661 2858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr1317-203ENSMUST00000214801 2578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm37331-201ENSMUST00000192367 3375 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Trav8n-2-201ENSMUST00000103632 408 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm24342-201ENSMUST00000103907 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm14435-202ENSMUST00000127687 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm28190-201ENSMUST00000189766 722 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 1700074H08Rik-201ENSMUST00000189831 555 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm45327-201ENSMUST00000211612 565 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm10916-201ENSMUST00000080330 483 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm23300-201ENSMUST00000082712 125 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Snord15a-201ENSMUST00000083888 148 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Ccnb3-202ENSMUST00000115752 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm26743-201ENSMUST00000180913 1726 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr510-204ENSMUST00000217170 2997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Macf1-201ENSMUST00000082108 17331 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Vmn1r47-202ENSMUST00000227229 6733 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm37862-201ENSMUST00000193079 2533 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm13677-201ENSMUST00000120739 595 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm12103-201ENSMUST00000121892 362 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Prl2c5-202ENSMUST00000126540 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm12869-201ENSMUST00000156265 344 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm27235-201ENSMUST00000184431 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm28900-201ENSMUST00000185232 156 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm6680-201ENSMUST00000192789 950 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm43875-201ENSMUST00000203319 2475 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Zfp981-203ENSMUST00000179175 2953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm43648-201ENSMUST00000197775 2485 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 1810006J02Rik-201ENSMUST00000186473 1687 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Serpinb3c-201ENSMUST00000027565 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm12495-201ENSMUST00000119750 447 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm44254-201ENSMUST00000204184 322 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm32443-202ENSMUST00000220011 773 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Ear-ps9-202ENSMUST00000226796 245 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm44177-201ENSMUST00000204338 2667 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr1489-202ENSMUST00000217182 11140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm14810-201ENSMUST00000121628 486 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 4930587E11Rik-202ENSMUST00000204857 807 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 AC153361.1-201ENSMUST00000219679 247 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Xiap-202ENSMUST00000055483 6374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 2410024N13Rik-201ENSMUST00000090704 669 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr446-204ENSMUST00000216199 4218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Ktn1-201ENSMUST00000022391 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm9611-201ENSMUST00000100698 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm12432-201ENSMUST00000119540 186 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm24936-201ENSMUST00000122598 247 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm25290-201ENSMUST00000122796 144 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm3633-202ENSMUST00000163102 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 1700027I24Rik-201ENSMUST00000183612 696 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm7652-201ENSMUST00000200440 1151 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm44060-201ENSMUST00000204440 410 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm8035-201ENSMUST00000204625 687 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 AC153971.2-201ENSMUST00000214553 777 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
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