Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm14825-201ENSMUST00000113538 701 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 Gm15274-201ENSMUST00000131442 291 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 Gm21979-201ENSMUST00000139887 291 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 Gm15259-201ENSMUST00000151262 291 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 Gm24220-201ENSMUST00000177753 79 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 Gm25988-201ENSMUST00000177759 79 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 Gm23471-201ENSMUST00000177886 79 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 Gm26488-201ENSMUST00000178225 79 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 Gm23449-201ENSMUST00000179208 79 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 Gm25221-201ENSMUST00000180051 79 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 Scgb2b9-ps-201ENSMUST00000189522 334 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 Gm28724-202ENSMUST00000194218 295 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 Obox4-ps24-201ENSMUST00000197686 540 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 Gm40155-201ENSMUST00000198291 818 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 1700065L07Rik-201ENSMUST00000204961 614 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 Gm35625-202ENSMUST00000211040 266 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 Gm18645-202ENSMUST00000212222 760 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 Olfr337-ps1-202ENSMUST00000213375 526 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 Mbd3l1-202ENSMUST00000213625 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 4930401A07Rik-201ENSMUST00000214657 746 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 Gm18903-201ENSMUST00000215343 480 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 AC160124.1-201ENSMUST00000215539 519 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 Olfr790-204ENSMUST00000218901 1070 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 AC153975.1-201ENSMUST00000220087 926 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 AC134537.3-201ENSMUST00000220154 503 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 AC154692.1-201ENSMUST00000228314 544 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 Olfr790-201ENSMUST00000056002 1070 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 5430402E10Rik-201ENSMUST00000063127 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 Gm24950-201ENSMUST00000082768 191 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 Gm23971-201ENSMUST00000083317 191 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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Rtf1A2AQ19 Gm26316-201ENSMUST00000083886 191 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 Rnu2-10-201ENSMUST00000084010 191 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 Prl2b1-201ENSMUST00000091678 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 Vmn2r82-201ENSMUST00000170596 3045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 Cyp3a13-201ENSMUST00000031741 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 Olfr290-202ENSMUST00000214501 5196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 Olfr290-204ENSMUST00000216367 5182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 Gm10811-201ENSMUST00000221985 2448 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 Olfr1274-ps-202ENSMUST00000216111 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 Usp34-208ENSMUST00000180046 12200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 Olfr364-ps1-203ENSMUST00000217298 2894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 Olfr1242-204ENSMUST00000216001 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 Olfr992-203ENSMUST00000214895 2222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 Lrrtm2-201ENSMUST00000091636 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 Gm12649-201ENSMUST00000137509 581 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 1700057G04Rik-206ENSMUST00000185580 842 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rtf1A2AQ19 Gm8600-201ENSMUST00000186320 905 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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Rtf1A2AQ19 Gm42621-201ENSMUST00000198114 275 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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Rtf1A2AQ19 AC158686.2-201ENSMUST00000218599 976 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
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Rtf1A2AQ19 Olfr1318-201ENSMUST00000058176 1690 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rtf1A2AQ19 AI504432-201ENSMUST00000070085 5569 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rtf1A2AQ19 Cr2-212ENSMUST00000210219 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rtf1A2AQ19 A230081H15Rik-201ENSMUST00000218326 2929 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rtf1A2AQ19 Wfdc18-201ENSMUST00000001009 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rtf1A2AQ19 Igkv4-69-201ENSMUST00000103349 348 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
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Rtf1A2AQ19 Gimap4-204ENSMUST00000119575 900 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rtf1A2AQ19 Gm14623-201ENSMUST00000121398 603 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rtf1A2AQ19 Gm16064-201ENSMUST00000154997 464 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rtf1A2AQ19 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rtf1A2AQ19 Tspy-ps-202ENSMUST00000172304 321 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rtf1A2AQ19 Snord92-201ENSMUST00000175548 85 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rtf1A2AQ19 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rtf1A2AQ19 Gm28030-201ENSMUST00000184987 138 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rtf1A2AQ19 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rtf1A2AQ19 E330037G11Rik-201ENSMUST00000204295 1086 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rtf1A2AQ19 Gm45659-201ENSMUST00000209295 564 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rtf1A2AQ19 Gm18039-201ENSMUST00000217816 728 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rtf1A2AQ19 AC158392.2-201ENSMUST00000225402 969 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rtf1A2AQ19 Rps15a-ps1-201ENSMUST00000071120 393 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rtf1A2AQ19 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rtf1A2AQ19 Gm24533-201ENSMUST00000083138 196 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rtf1A2AQ19 Gm24319-201ENSMUST00000083389 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rtf1A2AQ19 Gm10356-201ENSMUST00000097152 1258 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rtf1A2AQ19 Olfr583-201ENSMUST00000098211 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rtf1A2AQ19 Gm10780-201ENSMUST00000099459 285 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rtf1A2AQ19 Acsm3-202ENSMUST00000106526 2704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rtf1A2AQ19 Olfr172-202ENSMUST00000214139 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
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