Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP4

Serpinb6c, Serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B, member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpinb6cW4VSP4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Serpinb6cW4VSP4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Serpinb6cW4VSP4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Serpinb6cW4VSP4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Serpinb6cW4VSP4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Serpinb6cW4VSP4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Serpinb6cW4VSP4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Serpinb6cW4VSP4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Serpinb6cW4VSP4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Serpinb6cW4VSP4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Serpinb6cW4VSP4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Serpinb6cW4VSP4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Serpinb6cW4VSP4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Serpinb6cW4VSP4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Serpinb6cW4VSP4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Serpinb6cW4VSP4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Serpinb6cW4VSP4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Serpinb6cW4VSP4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Serpinb6cW4VSP4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Serpinb6cW4VSP4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Serpinb6cW4VSP4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Serpinb6cW4VSP4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Serpinb6cW4VSP4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Serpinb6cW4VSP4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Serpinb6cW4VSP4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Serpinb6cW4VSP4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms