Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3550W4VSN7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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