Protein–RNA interactions for Protein: V9GXQ2

Gm17087, Predicted gene 17087, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17087V9GXQ2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17087V9GXQ2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17087V9GXQ2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17087V9GXQ2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm17087V9GXQ2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm17087V9GXQ2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm17087V9GXQ2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm17087V9GXQ2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm17087V9GXQ2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17087V9GXQ2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17087V9GXQ2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17087V9GXQ2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17087V9GXQ2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17087V9GXQ2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17087V9GXQ2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17087V9GXQ2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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Gm17087V9GXQ2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17087V9GXQ2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17087V9GXQ2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17087V9GXQ2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17087V9GXQ2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17087V9GXQ2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17087V9GXQ2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17087V9GXQ2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17087V9GXQ2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Gm17087V9GXQ2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17087V9GXQ2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17087V9GXQ2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17087V9GXQ2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17087V9GXQ2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17087V9GXQ2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17087V9GXQ2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17087V9GXQ2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17087V9GXQ2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17087V9GXQ2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17087V9GXQ2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17087V9GXQ2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm17087V9GXQ2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17087V9GXQ2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm17087V9GXQ2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17087V9GXQ2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17087V9GXQ2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17087V9GXQ2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17087V9GXQ2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17087V9GXQ2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17087V9GXQ2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17087V9GXQ2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17087V9GXQ2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17087V9GXQ2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm17087V9GXQ2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm17087V9GXQ2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17087V9GXQ2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm17087V9GXQ2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
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Gm17087V9GXQ2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm17087V9GXQ2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17087V9GXQ2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17087V9GXQ2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17087V9GXQ2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17087V9GXQ2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17087V9GXQ2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17087V9GXQ2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17087V9GXQ2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17087V9GXQ2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17087V9GXQ2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17087V9GXQ2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17087V9GXQ2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17087V9GXQ2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17087V9GXQ2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm17087V9GXQ2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17087V9GXQ2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17087V9GXQ2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17087V9GXQ2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17087V9GXQ2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17087V9GXQ2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17087V9GXQ2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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