Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mbd1Q9Z2E2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd1Q9Z2E2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms