Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ddx39bQ9Z1N5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddx39bQ9Z1N5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms