Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne6Q9Z140 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms