Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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Sh3bp5Q9Z131 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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Sh3bp5Q9Z131 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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Sh3bp5Q9Z131 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Sh3bp5Q9Z131 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Sh3bp5Q9Z131 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Sh3bp5Q9Z131 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Sh3bp5Q9Z131 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Sh3bp5Q9Z131 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Sh3bp5Q9Z131 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Sh3bp5Q9Z131 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Sh3bp5Q9Z131 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms