Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbp2Q9Z0E6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp2Q9Z0E6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp2Q9Z0E6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp2Q9Z0E6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp2Q9Z0E6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp2Q9Z0E6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp2Q9Z0E6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp2Q9Z0E6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp2Q9Z0E6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp2Q9Z0E6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp2Q9Z0E6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp2Q9Z0E6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp2Q9Z0E6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp2Q9Z0E6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp2Q9Z0E6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp2Q9Z0E6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp2Q9Z0E6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp2Q9Z0E6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp2Q9Z0E6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp2Q9Z0E6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp2Q9Z0E6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp2Q9Z0E6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp2Q9Z0E6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp2Q9Z0E6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp2Q9Z0E6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp2Q9Z0E6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp2Q9Z0E6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gbp2Q9Z0E6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp2Q9Z0E6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp2Q9Z0E6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp2Q9Z0E6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp2Q9Z0E6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp2Q9Z0E6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp2Q9Z0E6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp2Q9Z0E6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp2Q9Z0E6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp2Q9Z0E6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gbp2Q9Z0E6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gbp2Q9Z0E6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Gbp2Q9Z0E6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gbp2Q9Z0E6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gbp2Q9Z0E6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gbp2Q9Z0E6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms