Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nme3Q9WV85 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms