Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Apobec2Q9WV35 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apobec2Q9WV35 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apobec2Q9WV35 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apobec2Q9WV35 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apobec2Q9WV35 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Apobec2Q9WV35 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apobec2Q9WV35 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Apobec2Q9WV35 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apobec2Q9WV35 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apobec2Q9WV35 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apobec2Q9WV35 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apobec2Q9WV35 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apobec2Q9WV35 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apobec2Q9WV35 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apobec2Q9WV35 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apobec2Q9WV35 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apobec2Q9WV35 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec2Q9WV35 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec2Q9WV35 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec2Q9WV35 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec2Q9WV35 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec2Q9WV35 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apobec2Q9WV35 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms