Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lemd3Q9WU40 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lemd3Q9WU40 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lemd3Q9WU40 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms