Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TapbpQ9R233 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TapbpQ9R233 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms