Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zeb2Q9R0G7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms