Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas3Q9QZQ0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Npas3Q9QZQ0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms