Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnnt3Q9QZ47 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnnt3Q9QZ47 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms