Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndrg3Q9QYF9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndrg3Q9QYF9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndrg3Q9QYF9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndrg3Q9QYF9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndrg3Q9QYF9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndrg3Q9QYF9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndrg3Q9QYF9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndrg3Q9QYF9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndrg3Q9QYF9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndrg3Q9QYF9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndrg3Q9QYF9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndrg3Q9QYF9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndrg3Q9QYF9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndrg3Q9QYF9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndrg3Q9QYF9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndrg3Q9QYF9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndrg3Q9QYF9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndrg3Q9QYF9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndrg3Q9QYF9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndrg3Q9QYF9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndrg3Q9QYF9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndrg3Q9QYF9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndrg3Q9QYF9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndrg3Q9QYF9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndrg3Q9QYF9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndrg3Q9QYF9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndrg3Q9QYF9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndrg3Q9QYF9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndrg3Q9QYF9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndrg3Q9QYF9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndrg3Q9QYF9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndrg3Q9QYF9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndrg3Q9QYF9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndrg3Q9QYF9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndrg3Q9QYF9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ndrg3Q9QYF9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndrg3Q9QYF9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms