Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxe3Q9QY14 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxe3Q9QY14 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxe3Q9QY14 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxe3Q9QY14 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxe3Q9QY14 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxe3Q9QY14 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxe3Q9QY14 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxe3Q9QY14 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxe3Q9QY14 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxe3Q9QY14 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxe3Q9QY14 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxe3Q9QY14 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxe3Q9QY14 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxe3Q9QY14 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxe3Q9QY14 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxe3Q9QY14 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxe3Q9QY14 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxe3Q9QY14 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxe3Q9QY14 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxe3Q9QY14 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxe3Q9QY14 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxe3Q9QY14 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxe3Q9QY14 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxe3Q9QY14 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxe3Q9QY14 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxe3Q9QY14 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxe3Q9QY14 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxe3Q9QY14 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxe3Q9QY14 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxe3Q9QY14 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxe3Q9QY14 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxe3Q9QY14 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxe3Q9QY14 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxe3Q9QY14 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxe3Q9QY14 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms