Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX66

Dpf1, Zinc finger protein neuro-d4, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf1Q9QX66 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Dpf1Q9QX66 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dpf1Q9QX66 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dpf1Q9QX66 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dpf1Q9QX66 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dpf1Q9QX66 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dpf1Q9QX66 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dpf1Q9QX66 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dpf1Q9QX66 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dpf1Q9QX66 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dpf1Q9QX66 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Dpf1Q9QX66 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dpf1Q9QX66 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dpf1Q9QX66 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dpf1Q9QX66 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dpf1Q9QX66 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dpf1Q9QX66 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dpf1Q9QX66 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dpf1Q9QX66 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dpf1Q9QX66 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dpf1Q9QX66 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms