Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trpc5Q9QX29 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms