Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcea2Q9QVN7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms