Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dkk3Q9QUN9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dkk3Q9QUN9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms