Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cln8Q9QUK3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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