Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm2bQ9JME9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms