Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms