Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SrfQ9JM73 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms