Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLQ0

Cd2ap, CD2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd2apQ9JLQ0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd2apQ9JLQ0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd2apQ9JLQ0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd2apQ9JLQ0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd2apQ9JLQ0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd2apQ9JLQ0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd2apQ9JLQ0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd2apQ9JLQ0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd2apQ9JLQ0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd2apQ9JLQ0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd2apQ9JLQ0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd2apQ9JLQ0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd2apQ9JLQ0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd2apQ9JLQ0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd2apQ9JLQ0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd2apQ9JLQ0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd2apQ9JLQ0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd2apQ9JLQ0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cd2apQ9JLQ0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cd2apQ9JLQ0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms