Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Tgm1Q9JLF6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Tgm1Q9JLF6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Tgm1Q9JLF6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Tgm1Q9JLF6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tgm1Q9JLF6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Tgm1Q9JLF6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm1Q9JLF6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm1Q9JLF6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm1Q9JLF6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm1Q9JLF6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm1Q9JLF6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm1Q9JLF6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm1Q9JLF6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm1Q9JLF6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm1Q9JLF6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Tgm1Q9JLF6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm1Q9JLF6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm1Q9JLF6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm1Q9JLF6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm1Q9JLF6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm1Q9JLF6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm1Q9JLF6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm1Q9JLF6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm1Q9JLF6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm1Q9JLF6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm1Q9JLF6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm1Q9JLF6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm1Q9JLF6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tgm1Q9JLF6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgm1Q9JLF6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgm1Q9JLF6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgm1Q9JLF6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms