Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Habp4Q9JKS5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Habp4Q9JKS5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms