Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AtrQ9JKK8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms