Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mrpl39Q9JKF7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mrpl39Q9JKF7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms