Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nectin1Q9JKF6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nectin1Q9JKF6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms