Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scamp5Q9JKD3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms