Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ybx3Q9JKB3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms