Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Uchl3Q9JKB1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Uchl3Q9JKB1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms