Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ4

Ube2j1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2j1Q9JJZ4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms