Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh3bgrlQ9JJU8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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